安徽省农业科学院和安徽农业大学都是与农业相关的机构，他们不管在业务上还是行政上都有着千丝万缕的联系。翻看安徽农业大学历史沿革，还会发现1960年10月到1962年7月两者还有过短暂合集，之后又分开了。两个单位为什么要合并？合并后为什么又分开了？就让档案来揭开这段尘封的历史，解答人们的疑问。

安徽省农业科学院的前身是安徽省农业科学研究所。在特定的历史情况下，为了能够在提高教学质量的同时，更全面、更深入地开展科学研究，1960年10月11日，安徽省委决定：1.安徽省农业科学研究所改为安徽省农业科学院，与安徽农学院合并，一个机关两个招牌。由农学院党委书记陈作霖同志兼任农业科学院党委书记；农学院副院长王劲草同志兼农业科学院院长；原农科所所长郭敬一同志任农业科学院副院长。2.慈惟纪同志任安徽农学院副院长。

1960年10月15日，安徽省委批准了安徽农学院和安徽省农业科学院合并后的机构设置。并于同年12月19日明确了安徽农学院与农业科学院合并后的具体问题。

1960年12月22日，安徽农学院与农业科学院合并后的院务委员会正式成立，共55人，陈作霖任主任，姚文铃、张佐文、王劲草、杨演、慈惟纪、郭敬一为副主委。第一次院务会由主任委员陈作霖同志主持，讨论了全院各项工作。

1961年1月1日，党委根据两院合并后的情况，决定将《安徽农学院学报》改为《安徽农业科学》。《安徽农业科学》的任务是刊登两院对全省农业生产有指导作用的学术论文。

1961年1月20日，共青团安徽农学院、安徽省农业科学院召开合并后的第一次团员代表大会，历时一天半，参加会议的正式代表307人、列席代表7人。

两院合并后技术力量增强了，利用设备、开展学术活动也方便了很多。但由于两院工作的任务、性质和方法不同，有许多事情无法统一，工作中矛盾很多，许多工作顾此失彼，严重影响了两院任务的完成。

1962年3月2日，党委会专门讨论了农学院、农业科学院党的领导关系问题，得出农学院与农业科学院合并后一年多的实践证明统一领导的好处不多、问题不少的结论。遂于3月5 日请示省委农工部：两院党的领导分开，农业科学院单独设立党委组织；如果不分开，领导力量必须加强，要有一位书记专管农业科学院的工作。两院党委统一领导要有一个工作细则。

1962年4月24日， 省委同意将安徽农学院与安徽农业科学院党委会分开，由两院单独成立党委会。

1962年7月8日上午，关于农学院、农业科学院的分院问题，安徽农学院与安徽农业科学院党委会再次召开会议，省委农工部副部长陈振亚同志出席了会议。大家认为，为了加强两院的领导工作，更好地搞好教学和科学研究工作，一致同意两院党的领导分开。蚕桑研究所仍放在农学院，保持永远不动，由农业科学院直接领导。会后分别宣布两院正式分开。

1962年11月28日，安徽省委正式下文：安徽农学院与安徽农业科学院党委分开,两院分别成立党委会。这两个党委直属省委领导，具体工作委托农口管理。

自此安徽农学院与安徽农业科学院正式分开。